新冠疫情肆虐，除了疫情本身擴大傳播之外，另一個隱形的戰場也正熱鬧開打，那就是政治與外交的博弈。
互拒對方於境外
為防止新冠肺炎疫情擴散，日本政府宣布從3月9日起，對來自中國與南韓的旅客實施較為嚴格的入境管制措施。除了來自這兩國的旅客必須進行隔離檢疫14天才能入境之外，也限制中國（包括香港及澳門）和南韓航班，只能降落在東京成田機場及大阪關西機場。
對此，南韓也立刻宣佈反擊，自3月9日起，暫停日本免簽證入境效力；此外，也對自日本入境的所有外籍遊客，採取特別入境管制措施。同時，南韓也將制日本航班降落的機場。
南韓清楚表明，這些管制措施都是衝著日本之前對南韓管制措施而來，很明顯的，這是一種報復，因為南韓對日本未經商議就「片面」宣佈對南韓旅客實施入境隔離，感到憤怒。
日與韓、中與美互槓
中國文化和旅遊部2月24日，發出赴美旅遊安全提醒指出，因美方的過度防疫措施以及美國內安全形勢，呼籲中國遊客提高安全防範意識，切勿前往美國旅遊。
中國做此提醒的理由有二，一是美國「防疫過度」，二是美國「疫情升高」。這兩個看似互相矛盾的理由，恰恰好說明疫情在政治和外交上的後坐力。
1月31日WHO將新型冠狀病毒疫情列為「國際關注的公共衛生緊急事件」，但並不建議各國對中國進行旅遊限制。不過，美國國務院立即將對中國的旅遊警示，提升到最高等級的第四級，呼籲美國國民不要前往。
在此之前，美國早在1月29日就派出專機至武漢進行撤僑。無論是旅遊禁令還是撤僑行動，美國的速度都非常快，令中國感到強烈的不善意，再加上美國的疫情也已迅速升溫，因此中國官方呼籲其國民不要前往。很明顯的，這也是一個外交角力大於防疫考慮的案例。
我國顧忌美、日
全球化鼓勵人貨交流，新冠疫情卻要求互動越少越好，但是到底什麼時候要宣佈對什麼國家的國民實施入境限制，除了該國的疫情發展之外，外交上也有很多必須斟酌之處，例如，蔡政府遲遲不提升對日本和美國的旅遊警示，就被認為與外交考量有關。
之前菲律賓民航委員會佈，14天內到過中國、香港、澳門的旅客，暫時禁止入境，菲律賓並表示，依據所謂的一中政策，上述措施實施對象也包括台灣。此項宣佈引發國人高度不滿，要求外交部「硬起來」，因此，蔡政府宣稱將考慮祭出取消對菲律賓免簽證、中止台菲農漁業交流等措施。未幾，菲律賓衛生部長杜克隨即宣佈取消對台限制令。
第二波戰役
菲律賓的政策為什麼會大轉彎？除了杜克從公衛的角度所強調的，因為台灣疫情並不嚴重之外，相信台灣可能的反制措施，也是菲國考量之一，畢竟台菲間的交流是很密切的，台灣觀光客在菲律賓排名第5，菲律賓在台灣的外籍勞工人逾15萬人。
為了好好保護國人，各國正全力進行防疫大作戰，不過，戰線要拉得多遠，則往往有超越疫情進展的政治和外交考量，這是新冠肺炎帶來的第二波戰役，如何發展，值得觀察。