開放含萊克多巴胺（俗稱：瘦肉精）美豬進口始終是台美貿易談判的一大障礙，加以兩岸關係惡化對美依賴加深，使得蔡政府承受的壓力越來越大。由於國內養豬跟養牛產業規模大不同，且國人多以豬肉為主食，馬前政府採取「牛豬分離」策略，僅開放含瘦肉精美牛進口，影響層面有限。
美豬進口持續施壓
改朝換代後美方希望台灣開放含瘦肉精美豬進口壓力不減，特別是在美方力挺蔡總統連任後，這樣的聲量更加急迫，加上台灣內部也有人認為在兩岸關係惡化的情況下，台灣若能與美國簽訂自由貿易協定（FTA）對台灣政治、經濟即與其他國家簽訂FTA都會有很大的幫助，大敲邊鼓。
蔡政府迄今仍未點頭同意，讓美方相當不滿，不僅美國在台協會（AIT），美國商會多次直言該議題是台美貿易協議談判的一大障礙，美國國會甚至將不滿寫進對台法案，若兩岸緊張情勢未獲緩解，蔡政府挺不挺得住各界多所質疑。
健康風險疑慮
蔡政府遲遲不開放含瘦肉精美豬進口，除了時機考量外，主要有兩大顧慮。首先是食安問題；雖然美方堅稱萊克多巴胺對人體健康無害，但是因消費習性不同（豬肉為國人主食且豬內臟等也深受消費者喜愛），國內學者專家及食安團體對美方說法存疑。
事實上美國部分民眾對於萊克多巴胺的食品安全性同樣存疑，且國際間對萊克多巴胺的態度也存在高度分歧（不能證明有害，不等於絕對無害）。這部分蔡政府早已委請國內相關機構及專家，進行其對人體的健康風險評估，應將研究結果公諸大眾，讓科學證據說話，才能說服國人。
肉品競價打擊國產
由於美國豬肉具規模經濟（7千多萬頭）及價格優勢（美國養豬成本每公斤約45至50元，台灣生產成本每公斤約60至65元），若允許大量進口將會嚴重衝擊國產豬肉的市場佔有率及競爭力，損及國內養豬業者生計及對執政黨的支持度，不過台灣生產的豬肉風味絕佳（歐美採打針去勢，台灣公豬一出生就閹割沒有腥味）在品質上具國際競爭力。
儘管有國內年輕養豬業者及企業主強調，只要政府協助他們產業升級並做出品牌及市場區隔，他們並不憂心開放含瘦肉精美豬進口，只是這部分占現有養豬戶比率偏低，且建立品牌非易事，多數豬農還是表達反對之意。
也有國內經濟學者一再建言，可以採取日本模式，即進口美豬可含10ppb萊克多巴胺，但國產養豬則不准使用萊克多巴胺，並且在超市等終端市場，要求廠商標明產地，讓消費者可以清楚作出選擇。
開放含萊克多巴胺的美豬進口，不僅是經貿問題也是政治、國安議題，針對上述的疑慮，蔡政府理應有令人滿意的答案。至於該項承諾究竟只是台美FTA談判的入場券，還是簽訂台美FTA的保證書，關係產業的後續發展，主事者卻始終三緘其口，民眾要如何安心？民進黨已全面執政，任何法案均可輕易過關，但別忘了水可載舟亦可覆舟，物極必反的道理！