政府應考量到基改作物擁有極高的不可逆轉風險，及早建構完整的風險管理及溝通機制。
基改作物商業化議題一直存在爭議，根據媒體報導，中國國內超市販售的稻米經過抽驗，發現含有基因改造成分，證實中國基因改造稻米已悄悄流入民間種植，並採取基因改造米混入普通食米的非法方式，流入國內外市場，由於全球都還未核准基改稻米的商業種植，該報導已引發國際關注。
外型上難以分辨
儘管我國官方宣稱未進口中國稻米與米製品，但是鑑於近年來兩岸農產貿易和民間種原交流相當頻繁，是否透過其他管道進入，台灣相關部門還是應該徹查，以解民惑。
由於這些基改稻作和一般稻作在外型上沒有差別，米商和消費者都無從分辨難以進行風險管控，勢必影響到非基改稻作甚至有機稻作農民的銷售與生計，影響至為深遠。
歐盟雖然針對中國出口的米製品實施嚴苛的入境檢查，同時要求所有中國米製品在出口前，都必須出具不含基因改造的檢測報告，但還是不斷出包，有了前車之鑑，台灣政府不能掉以輕心， 以免影響相關農產品出口。
台灣雖然在基改作物研發技術上相當先進，但是國內並未允許商業化的基改作物種植，不過國內也曾發生基改木瓜種子外流， 以及彰化稻作遭紅米汙染等案例，值得警惕。
原料容易混入
特別是台灣農政主管官員日前主張讓稻米買賣回歸自由市場機制，同時也透過自經區大幅開放國外農產品原料進口加工，以及允許區內基改觀賞魚生產與出口，將增加國外基改原料混入的風險，是否會影響到台灣非基改農產品（包括食用魚）的生產和出口，政府應該要審慎看待。
政府應加強稻米種子進口把關（包括建立各國互相認可的基因改造作物風險評估方法與法規， 以及檢驗技術和設施）外，應該考慮將進口稻米有無含基改成分列入檢驗項目‧ 並立即檢查中國基改水稻是否流入國內種植， 以免對國內稻米產業造成無可彌補的傷害。
建構管控機制
基改作物是因應氣候變遷與糧荒危機的選項之一（非惟一）， 鑑於少數跨國公司可能透過基改品種專利權掌控全球糧食，為免受制於人，我國政府應該鼓勵基改相關研究，同時考量到基改作物擁有極高的不可逆轉風險， 相關基改研究領域應該更多元化（包括環境風險評估）並建構完整的風險管理及溝通機制。