吳茂昆將大學自主牽扯到學術自由，把兩者混為一談，顯然這位教育部長的基本觀念不合格。(photo by TVBS)
教育部長吳茂昆說「學術沒有真正民主」，並舉諾貝爾物理學獎得主楊振寧為例說，「楊振寧的成就可以用投票投出來嗎？」學術是為探討真理，而真理的研究有其自由，且真理確實不是靠投票投出來的。但吳茂昆將大學自主牽扯到學術自由，把兩者混為一談，且舉楊振寧例，看來又非口誤，顯然這位教育部長的基本觀念不合格。
早年國民黨一黨長期執政時期，經常以行政干預大學校園自主、甚至干擾學術研究自由，因此，民進黨在野時期，打著大學自主、學術自由等名號，要求政府開放校園自主，並尊重學術自由。依吳茂昆的概念，「學術研究」有自由、沒有民主，可以理解；但「校園自主」涉及學校治理的過程，而自主治理的過程，本來就要尊重民主精神與程序。
台大、清華等大學校園多位師生爭取捍衛大學自主，在台灣已三次政黨輪替的今天，對早年民進黨爭取校園自主的抗爭，是一大反諷。遴選委員的產生，遴選過程的投票，本來就是依一定的民主程序產生。
在管中閔依現行各相關法規並無重大違規的情況下，吳茂昆甫上台就拔管，即使管中閔擔任獨董一事未充分揭露（遴選辦法未規定要揭露），就好像一個人開車誤走路肩或誤壓紅線，便將對方判刑關押一樣，明顯不合法理。
更何況，就台大遴選委員會對管中閔此一未揭露獨董的「可能疏失」，並未認為足以影響其當選的正當性。吳茂昆此舉，對台大遴選委員會可說是極大的不尊重，甚且是已達污辱的作為。