為了加速行政效率，蔡英文總統決定從10月開始，每個禮拜一召開「執政決策協調會議」，由她親自主持，10月3日已開了第一次協調會議；值得關注的是，與會成員除了行政院長林全和副院長林錫耀、立法院民進黨團總召柯建銘和幹事長吳秉叡之外，還包括民進黨秘書長洪耀福和智庫執行長邱義仁，以及六都中綠色執政的縣市長等。
上個禮拜五才公開表示「沒有請辭」一事的前金管會主委丁克華，在蔡英文於協調會議前，就請辭並迅速獲准—是否他已知道蔡英文將在該會議中，針對兆豐案裁示要追究監理及管理疏失責任？此外，行政院督導小組也因認定「前任督管疏失、現任應作為而不作為」，3日決定，將金管會與財政部前任、現任共6位首長，移送監察院追究責任。
政院領導不力？
雖然前民進黨立委林濁水質疑蔡總統親自主持的「執政決策協調會議」宛如「太上行政院會」，將弱化行政院會的功能，但是綠委及綠嘴屢屢批判行政院處理一例一休爭議與兆豐案延宕多時，協調會議卻可快速結案，對林全來說，不啻是一大警訊，突顯其領導不力、效率不彰。
只是如果未來政府政策都得由蔡總統拍板才能定案，意味著行政院院長的職權與位階遭到貶抑，由目前的雙首長制走向總統制。在《憲法》尚未修改前，這樣的實質變動是否合宜、合法，不無疑慮。
另一件值得關切的事，是有關明年棒球經典賽的與賽陣容和教練爭議，「中華民國棒球協會」和「中華職棒大聯盟」意見不合、幾度齟齬。除了2單位原有的心結與利益糾葛之外，也跟蔡政府新成立的「行政院體育運動發展推動委員會」介入協調有關。
##體育行政疊床架屋
長期以來，體育相關事務由體育署（改制前為行政院體育委員會、教育部體育司）負責，忽然間新成立了一個「體發會」，負責統籌、制定國家體育運動政策，體育署變成了下級單位，像是個打雜的小弟，只負責聯繫和通知的工作。這是非常不恰當的做法，體育署是法定單位，成員需經過國家考試，體發會則是任務編制機構，人員均為指派，全憑行政院長官喜好而定，但是體發會卻可以指揮體育署，也可以決定經典賽（奧運等級）的相關政策，引發體育界的憂慮與不服。
民進黨政府執政後，類似執政決策協調會議、體發會之類的組織，大量橫空出世。這些組織有些與行政院既有單位的功能重疊，有些則被賦予過度的權責，然其合法性與適法性，卻讓人高度質疑。例如「原住民轉型正義委員會」、「不當黨産追討委員會」、「年金改革委員會」、「課綱審議委員會」等，這些委員會大都是僅憑總統一句話就風風火火的成立，但是運作了幾個月，幾乎一事無成。
例如新南向辦公室從直屬總統府改隸行政院，其實已幾如休眠；又如年金改革會議吵了幾個月沒有結論，最後政府決定在明年召開年金改革國是會議，屆時是不是又要搞成一場大拜拜呢？
蔡英文政府不斷設立體制外的組織，又在法源不明的情況下，賦予凌駕既有組織的權責，資源重複、浪費，也造成決策混亂。相關問題已越來越嚴重，必須儘速解決、回歸正常體制，才是正辦。