口腔微生物是決定一個人生病、罹癌、產生腫瘤抗藥性、復發和轉移的重要因素之一；牠們是人體第二大微生物群，包含多達700種不同細菌、真菌、病毒和原生動物。口腔是微生物和宿主相互作用的複雜環境，通過信號傳送，微生物會適應環境變化、防禦入侵並形成生物膜以進行定居。(https://microbiomejournal.biomedcentral.com/articles/10.1186/s40168-022-01262-7)(https://journals.sagepub.com/doi/full/10.1177/1533033820962117)
生態失調影響大
健康人體的核心微生物群是相似的，至於可變微生物群則由外部因素和獨特生理變化所共同塑造。因此實際上口腔微生物的整體組成，在發展過程是根據遺傳和環境因素而異。通過與宿主的共同進化，微生物群會在消化、代謝、解毒和免疫調節中發揮複雜作用，導致所有一切都可能致病的發生和演進。
口腔微生物失衡或適應不良，稱為生態失調，會影響局部疾病包括牙周病、齲齒和口腔癌局及多種全身性疾病，如糖尿病、心血管疾病、類風濕性關節炎、阿茲海默症、骨質疏鬆症、肺病和口腔疾病、足月分娩知發生。 最近的研究發現人類口腔微生物群與癌症、抗藥性、復發和轉移之間有密切的關係，像是食道癌、肝癌、胃癌、乳腺癌、肺癌、結腸癌和直腸癌。另外Stolzenberg-Solomon等人與Chang等人，也分別證實牙齒脫落及牙周病與罹患胰臟癌間的相關性。
每天吞嚥2000次
口腔生態失調中大量繁殖的致病菌，以牙齦卟啉單胞菌為例，牠會直接造成組織發炎、表現出許多潛在毒素因子、破壞信號通路、抑制腫瘤細胞凋亡、再發、幫助腫瘤細胞逃避免疫並破壞組織。
一個人平均每天會吞嚥大約2000次。唾液和口腔內容物穿過食道、胃、十二指腸、壺腹與胰腺相連。微生物群定居在這些組織的一種可能機制，就是透過口腔穿過消化道，回流到胰管並直接播種到胰腺。研究發現頰、齦上和唾液樣本及胰管和胰腺組織統計學上存在顯著相似性，如果將人類唾液移殖到無菌小鼠體內，可以發現移植的口腔微生物群會定居於小鼠小腸。
抽煙也是罹癌的主因之一，原因正是因為煙草中的微生物可以直接改變口腔微生物群。這不僅影響口腔內的細菌濃度，還會影響口腔生物膜的形成。通過改變氧氣和pH值造成細胞環境紊亂，口腔細菌群落中的微需氧和厭氧微生物發生選擇。
臨床上可有改善
里克爾梅等人分析胰臟癌長、短期存活患者的胰腺微生物組，發現長期存活的微生物組具有更高的多樣性，並且腫瘤微生物組特徵，像是利用假黃單胞菌、鏈黴菌、糖多孢菌、克勞氏芽孢桿菌在多變量分析中甚至可以預測生存率。
未來，對于部分疾病甚至癌症在發病前顯然也可以利用鑑別口腔微生物的變化，而口腔微生物也可能影響疾病與癌症的管理和治療。口腔微生物採樣似乎可以應用於選擇治療方式，並評估接受手術切除、放療或化療的患者的反應。
臨床應用上，通過抗生素、益生元、益生菌和微生物移植糾正口腔生態失調，可能也會改善疾病、破壞腫瘤生長，提高癌症療效和可持續性。